A través de un examen clínico y una analítica de sangre es posible establecer un diagnóstico de sospecha de celiaquía.
En estos estudios se deben incluir los marcadores serológicos de la enfermedad celiaca, como son anticuerpos antigliadina, antiendomisio y antitransglutaminasa tisular.
A pesar de que este sistema es efectivo en muchos casos, no siempre es posible determinar la patología solo con ellos y es necesario recurrir a una biopsia intestinal extracción de una pequeña parte del tejido del intestino delgado a través de una endoscopia.
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